Dans le monde des morts, il y a des dieux de la mort qui possèdent des cahiers nommés «death note» dans lesquels ils peuvent écrire les noms des humains qu'ils veulent voir mourir. Lorsque son nom est écrit dans l'un de ces « deathnote », l'humain décède d'une crise cardiaque.

Un jour, un dieu de la mort nommé Ryuk perd son death note et celui-ci tombe dans le monde des humains, au Japon. Un jeune étudiant nommé «Light Yagami» le voit tomber et le prend. Au moment où il le touche, il rencontre Ryuk qui était le propriétaire du death note. Maintenant c'est à Light d'écrire les noms de ceux qu'il veut voir mourir.

Un jour, les policiers japonnais apprennent que des criminels sont morts en prison d'une crise cardiaque étrange et enquêtent alors sur cette affaire avec un spécialiste...